コードからStoryBoardのViewControllerをインスタンス化する
http://www.rizastar.com/blog_xcode/access-storyboard-from-code/ こちらに書かれてることまんまですが...
1. StoryBoardにidentifierを設定
2. instantiateViewControllerWithIdentifierでinstance化
MTFlippedViewController *vc = (MTFlippedViewController*)[self.storyboard instantiateViewControllerWithIdentifier:@"MTFlippedViewController"];
カンタン! ちなみにselfはViewControllerオブジェクト。